天津新增的第137例病例全基因组测序结果是怎样的?
年6月22日从天津市疾控中心获悉,经天津市疾控中心对本市第137例确诊病例呼吸道标本的新冠病毒全基因组高通量测序和序列分析 ,中国疾控中心复核,确认与北京新发地市场相关病例的病毒序列完全相同,属于L基因型欧洲家系分支I。
月17日 ,天津市新增1例本土新冠肺炎确诊病例,为天津的第137例确诊患者 。但奇怪的是,患者未出天津 ,未接触确诊者,无疑似病例和确诊病例接触史。
信息分析:对测序数据进行生物信息分析,包括数据质量控制、变异检测、基因注释等 ,最终得到全基因组的测序结果。生物信息分析项目WGS的生物信息分析项目通常包括以下几个方面:变异检测:检测单核苷酸变异(SNV) 、插入和缺失(indel)、拷贝数变异(CNV)和结构变异(SV)等 。
外显子组测序:通过捕获基因组中全部外显子序列进行测序,可以直接发现与蛋白质功能变异相关的遗传突变,相对于全基因组测序更加经济。目标区域测序:对感兴趣的特定基因组区域进行深度测序 ,成本更低。简化基因组测序:对重要的和复杂性高的QTLS进行精细定位,降低基因组分析的复杂性 。
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